在“风都”左翔太郎的清风街，合伙人菲利普和索长明·海娅·舒兹经营着一家侦探事务所。看似和平的风背后，地下流传着神秘的组织，可以把普通人变成掺杂者的“邪恶盖亚储物带”。每个人都在神秘组织“花园之家”的核心，这造成了许多离奇事件，在风中有很大的影响。向太郎和菲利普，挑战了掺杂剂引起的离奇事件，用六个“盖亚记忆条”变成了假面骑士W，坚决反对元彬家族。元元家族的目的是什么？蒙面骑士W和菲利普有什么神秘的过去？隐藏着许多谜题，假面骑士W之战开始了...