故事的开头和《迷失》一样，从一架即将出事的飞机开始。迫降后，飞机上的所有人都死于一种神秘的病毒，FBI和各方调查组介入调查。但这只是故事的开始。然后联邦调查局的女特工奥利维亚·德纳姆和高智商的天才彼得·毕晓普将携手面对一系列不可思议的可怕现象。为了防止危机进一步蔓延，他们将寻求彼得疏远的父亲的帮助。他的父亲沃尔特·贝肖普博士被送进了精神病院。出院后，三人组成的调查组开始研究各种离奇事件。随着遇到的事情越来越多，沃尔特·贝肖普博士不为人知的一面逐渐浮出水面。影片中出现的一家名为巨力集团(Massive Dynamic)的尖端科技公司也与沃尔特·毕晓普(Walter Bishop)博士关系密切，其创始人曾与他在一个实验室共事。但是巨型能源公司的诡秘行为不得不让人怀疑它同一个...